반응형 실전연구생활8 양파 연구 이야기 - 이 곰팡이는 어떤 놈일까?-2 양파에서 곰팡이를 분리하고, 분리하면서 번호를 부여하고, 2-3일간 키우면서 오염되지 않고 분리되었는지 확인한 뒤, 오염된 놈들은 제거, 혹은 재분리하고.(이러면서 번호 재부여) 완전히 분리가 끝나면 생긴대로 모아서 제일 잘 나온 애들 몇을 추렸다. 그 추려진 곰팡이에서 gDNA를 추출하고, ITS, beta-tublulin, carmodulin 의 primer를 제작하여 PCR을 수행했고, 깨끗하게 뜬 밴드를 젤에서 잘라내어 업체에 시퀀싱을 보낸다. 그리하여 받게 된 시퀀스 결과. 이 결과는 다른 이미 보고된 다른 곰팡이들과 비교분석을 해야 한다. 일단 가장 일반적으로 많이 수행하는 ITS부터 해 보자. 오늘 우리가 볼 녀석은 G-O-23-1 이놈이다. 가락시장 양파에서 23번째로 분리된 첫번째 곰팡이.. 2020. 11. 10. 양파 연구 이야기 - 이 곰팡이는 어떤 놈일까? 이전 시간에는 시퀀싱 데이터를 얻었다. 그런데 이걸 어떤 과정으로 얻었는지는 이야기하지 않았다. 그럼 이야기해 보자. 생물학 실험실에서 시퀀싱 데이터를 얻는 방법은... 아니 일단 시퀀싱 데이터가 뭔지부터 알아보자. 생물의 DNA는 네가지 염기로 구성되어 있다. A 아데닌 G 구아닌 T 티민 C 시토신 이렇게 네 가지고 RNA의 경우에는 T 티민 대신 U 우라실이 대신 들어 있다. 일단 이건 접어두고. ACTG 중에 A,G는 퓨린계라고 하고 T,C는 피리미딘계라고 한다. 그리고 A랑 T가 상보적이고, G랑 C가 상보적이다. 상보적이란 말은 둘이 붙는다는 소리다. 조금 더 들어가자면 A랑 T는 2개의 수소결합으로 붙고 G랑 C는 3개의 수소결합으로 결합한다. 2칸짜리 블록, 3칸짜리 블록 이렇게 생각하면 .. 2020. 10. 27. 양파 연구 이야기 - 산 넘어 산 양파에서 분리한 250여개의 곰팡이... 이 다음에 해야 할 일은 다음과 같았다. 1. 250여개의 곰팡이가 정말로 하나의 곰파이만 분리되었는지 키우면서 확인할 것 2. 250여개의 곰팡이를 특징에 따라서 분류할 것 3. 분류한 곰팡이를 DNA 분석을 통해 종과 속을 알아낼 것 4. 그 중에서 양파에 병을 일으키는 곰팡이를 찾을 것. 5. 그 곰팡이가 알려져있는 곰팡이인지 새로운 곰팡이인지 확인할 것. 6. 알려진 곰팡이라 할지라도 양파에 병을 내는 것으로 알려진 곰팡이인지 그것이 아닌지 확인할 것. 7. 곰팡이에 병을 냈는데, 아직 알려진 곰팡이가 아니라면 코흐의 법칙을 통해 병을 냄을 증명할 것. 그리고 가장 힘든 것은 이 모든 과정을 혼자 알아가면서 해야 한다는 것이다. 선배가 한 분 있었지만, 종.. 2020. 10. 20. 이공계 대학원생 되기 - 실험실을 선택하기 전에 알아야 할 것들 이공계 대학 대학원생 되기 3 : 실험실을 선택하기 전에 알아야 할 것들 0. intro 1. 이공계 대학원이란 뭘 하는 곳인가? 2. 실험실을 선택하기 전에 알아야 할 것들 3. 실험을 하기 위해 필요한 것들. 졸업. 2. 실험실을 선택하기 전에 알아야 할 것들 – 논문과 지구용사 안녕하신가!! 바로 시작하겠다. 대학원에 있는 실험실에 들어간다는 것은, 니 공부 니가 알아서 하기 위해서 배우러 가는 곳이다. 라는 것이었다. 그렇다면 그 공부란 무엇인지 알아 보자. 알아서 해야 할 공부 말이다. 대학원생이 되려는 당신이 해야 하는 공부는 매우, 거창하다. 당신이 속한 분야에서 당신이 알아낸 것을 되도록이면 많은 사람과 공유하는 것이다. 대학원생이 최종 진화해서 되야 하는 과학자라는 사람들. 그 사람들이 .. 2020. 8. 5. 이전 1 2 다음 반응형
